​​El objetivo general del programa es el de formar investigadores capaces de concebir, dirigir y realizar proyectos integrales en grupos multidisciplinarios con visión de liderazgo, en el campo de la biotecnología, bajo el marco de proyectos orientados hacia la generación de nuevos productos básicos y aplicados que tengan características de innovación y desarrollo tecnológico, así como de ejercer la docencia a nivel superior y de posgrado.

Al término del programa el alumno:

• Habrá integrado principios y conocimientos teóricos y experimentales que le permitirán comprender el desarrollo científico y tecnológico del área de la biotecnología.
• Aplicará sus conocimientos y habilidades para desarrollar protocolos de investigación que impacten positivamente en los sectores social y productivo.
• Adquirirá la capacidad de formular, dirigir y desarrollar proyectos de investigación y/o desarrollo tecnológico de alta calidad, formar grupos de investigación e interactuar con grupos multidisciplinarios.
• Será capaz de transmitir los conocimientos adquiridos dando continuidad a la formación de recursos humanos altamente capacitados. Adicionalmente, el programa tiene como meta:
• Consolidar el trabajo de investigación en red en el IPN, conjuntando a investigadores del Instituto Politécnico Nacional y creando sinergias entre las Unidades Académicas que integran la Red de Biotecnología.
• Proponer proyectos multisede y multidisciplinarios con orientación básica y aplicada que impacte en diferentes sectores sociales públicos y privados.